MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015574	TGT	2	6	219776	219781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986430
3502	NC_015574	CCA	2	6	219823	219828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986430
3503	NC_015574	T	6	6	220006	220011	0 %	100 %	0 %	0 %	333986430
3504	NC_015574	TTGAAG	2	12	220042	220053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986430
3505	NC_015574	TGA	2	6	220163	220168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986430
3506	NC_015574	GAG	2	6	220176	220181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986430
3507	NC_015574	A	6	6	220213	220218	100 %	0 %	0 %	0 %	333986430
3508	NC_015574	TGG	2	6	220219	220224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986430
3509	NC_015574	CATC	2	8	220410	220417	25 %	25 %	0 %	50 %	333986430
3510	NC_015574	TAA	2	6	220492	220497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986430
3511	NC_015574	GAA	2	6	220572	220577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986430
3512	NC_015574	GAAG	2	8	220689	220696	50 %	0 %	50 %	0 %	333986431
3513	NC_015574	GGTC	2	8	220807	220814	0 %	25 %	50 %	25 %	333986431
3514	NC_015574	TAA	2	6	220862	220867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986431
3515	NC_015574	GATG	2	8	220879	220886	25 %	25 %	50 %	0 %	333986431
3516	NC_015574	AGG	2	6	220899	220904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986431
3517	NC_015574	GTA	2	6	220951	220956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986431
3518	NC_015574	CAA	2	6	220959	220964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986431
3519	NC_015574	CAA	2	6	221000	221005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986431
3520	NC_015574	TC	3	6	221126	221131	0 %	50 %	0 %	50 %	333986431
3521	NC_015574	A	6	6	221149	221154	100 %	0 %	0 %	0 %	333986431
3522	NC_015574	TGG	2	6	221180	221185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986431
3523	NC_015574	AT	3	6	221186	221191	50 %	50 %	0 %	0 %	333986431
3524	NC_015574	CAA	2	6	221211	221216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986431
3525	NC_015574	ACA	2	6	221243	221248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986431
3526	NC_015574	TAT	2	6	221251	221256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986431
3527	NC_015574	GAA	2	6	221365	221370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986431
3528	NC_015574	AG	3	6	221413	221418	50 %	0 %	50 %	0 %	333986431
3529	NC_015574	A	7	7	221454	221460	100 %	0 %	0 %	0 %	333986431
3530	NC_015574	A	6	6	221819	221824	100 %	0 %	0 %	0 %	333986432
3531	NC_015574	CTAT	2	8	221938	221945	25 %	50 %	0 %	25 %	333986432
3532	NC_015574	AGTGG	2	10	221969	221978	20 %	20 %	60 %	0 %	333986432
3533	NC_015574	ATTG	2	8	222055	222062	25 %	50 %	25 %	0 %	333986432
3534	NC_015574	GAA	2	6	222290	222295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986432
3535	NC_015574	GAA	2	6	222359	222364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986432
3536	NC_015574	TGG	2	6	222377	222382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986432
3537	NC_015574	ATT	2	6	222429	222434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986432
3538	NC_015574	GAG	2	6	222446	222451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986432
3539	NC_015574	ATC	2	6	222469	222474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986432
3540	NC_015574	GTT	2	6	222527	222532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986432
3541	NC_015574	A	6	6	222619	222624	100 %	0 %	0 %	0 %	333986433
3542	NC_015574	ATTC	2	8	222811	222818	25 %	50 %	0 %	25 %	333986433
3543	NC_015574	T	6	6	222821	222826	0 %	100 %	0 %	0 %	333986433
3544	NC_015574	A	6	6	222854	222859	100 %	0 %	0 %	0 %	333986433
3545	NC_015574	ATT	2	6	222869	222874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986433
3546	NC_015574	TCA	2	6	222971	222976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986433
3547	NC_015574	TTA	2	6	222984	222989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986433
3548	NC_015574	TTTG	2	8	223024	223031	0 %	75 %	25 %	0 %	333986433
3549	NC_015574	ATC	2	6	223032	223037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986433
3550	NC_015574	CTG	2	6	223070	223075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986433
3551	NC_015574	TGG	2	6	223083	223088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986433
3552	NC_015574	CTC	2	6	223134	223139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986433
3553	NC_015574	GCA	2	6	223154	223159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986433
3554	NC_015574	T	6	6	223160	223165	0 %	100 %	0 %	0 %	333986433
3555	NC_015574	T	6	6	223170	223175	0 %	100 %	0 %	0 %	333986433
3556	NC_015574	ACA	2	6	223194	223199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986433
3557	NC_015574	TGAAT	2	10	223217	223226	40 %	40 %	20 %	0 %	333986433
3558	NC_015574	AGA	2	6	223599	223604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986434
3559	NC_015574	TGA	2	6	223608	223613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986434
3560	NC_015574	A	6	6	223747	223752	100 %	0 %	0 %	0 %	333986434
3561	NC_015574	AT	3	6	223757	223762	50 %	50 %	0 %	0 %	333986434
3562	NC_015574	ATA	2	6	223765	223770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986434
3563	NC_015574	TAT	2	6	223794	223799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986434
3564	NC_015574	TGA	2	6	223839	223844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986434
3565	NC_015574	AGC	2	6	223947	223952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986434
3566	NC_015574	TAA	2	6	223974	223979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986434
3567	NC_015574	TGG	2	6	223997	224002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986434
3568	NC_015574	AC	3	6	224057	224062	50 %	0 %	0 %	50 %	333986434
3569	NC_015574	CAT	2	6	224108	224113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986434
3570	NC_015574	GT	3	6	224179	224184	0 %	50 %	50 %	0 %	333986434
3571	NC_015574	ATGC	2	8	224185	224192	25 %	25 %	25 %	25 %	333986434
3572	NC_015574	GGA	2	6	224196	224201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986434
3573	NC_015574	ATT	2	6	224437	224442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986434
3574	NC_015574	ATT	2	6	224510	224515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986434
3575	NC_015574	ACAG	2	8	224539	224546	50 %	0 %	25 %	25 %	333986434
3576	NC_015574	TGC	2	6	224657	224662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986434
3577	NC_015574	TG	3	6	224685	224690	0 %	50 %	50 %	0 %	333986434
3578	NC_015574	ACA	2	6	224708	224713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986434
3579	NC_015574	GAA	2	6	224716	224721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986434
3580	NC_015574	ATC	2	6	224769	224774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986434
3581	NC_015574	TGATA	2	10	224788	224797	40 %	40 %	20 %	0 %	333986434
3582	NC_015574	GGAT	2	8	225032	225039	25 %	25 %	50 %	0 %	333986435
3583	NC_015574	CAA	2	6	225079	225084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986435
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3587	NC_015574	TGA	2	6	225282	225287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986435
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3589	NC_015574	TC	3	6	225328	225333	0 %	50 %	0 %	50 %	333986435
3590	NC_015574	GTT	2	6	225361	225366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986435
3591	NC_015574	AC	3	6	225375	225380	50 %	0 %	0 %	50 %	333986435
3592	NC_015574	AGG	2	6	225414	225419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986435
3593	NC_015574	TTG	2	6	225437	225442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986435
3594	NC_015574	GCA	2	6	225511	225516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986435
3595	NC_015574	A	7	7	225530	225536	100 %	0 %	0 %	0 %	333986435
3596	NC_015574	AAT	2	6	225816	225821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986435
3597	NC_015574	A	6	6	225833	225838	100 %	0 %	0 %	0 %	333986435
3598	NC_015574	TGA	2	6	225852	225857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986435
3599	NC_015574	CAGA	2	8	225889	225896	50 %	0 %	25 %	25 %	333986435
3600	NC_015574	ATA	2	6	225904	225909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986435
3601	NC_015574	CCAGC	2	10	225984	225993	20 %	0 %	20 %	60 %	333986435
3602	NC_015574	GAACT	2	10	226004	226013	40 %	20 %	20 %	20 %	333986435
3603	NC_015574	A	7	7	226027	226033	100 %	0 %	0 %	0 %	333986435
3604	NC_015574	CA	3	6	226054	226059	50 %	0 %	0 %	50 %	333986435
3605	NC_015574	GAT	3	9	226156	226164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986435
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3607	NC_015574	CAT	2	6	226215	226220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986435
3608	NC_015574	A	6	6	226359	226364	100 %	0 %	0 %	0 %	333986435
3609	NC_015574	A	7	7	226388	226394	100 %	0 %	0 %	0 %	333986435
3610	NC_015574	AAT	2	6	226401	226406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986435
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3613	NC_015574	GAC	2	6	226578	226583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986435
3614	NC_015574	TTG	2	6	226610	226615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986435
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3619	NC_015574	GAA	2	6	226726	226731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986435
3620	NC_015574	GAT	2	6	226750	226755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986435
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3622	NC_015574	GAA	2	6	226783	226788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986435
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3994	NC_015574	GAT	2	6	248337	248342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986456
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